Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM175Q9BSA9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms