Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms