Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.7 ms