Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms