Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM46DQ8NEK8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM46DQ8NEK8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM46DQ8NEK8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM46DQ8NEK8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM46DQ8NEK8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM46DQ8NEK8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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