Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ALYREFQ86V81 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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