Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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