Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDF6Q6KF10 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms