Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC27A3Q5K4L6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms