Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D3Q587I9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms