Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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GEN1Q17RS7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEN1Q17RS7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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