Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPE65Q16518 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms