Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYTH1Q15438 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms