Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
R3HDM1Q15032 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms