Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms