Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHPRHQ149N8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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