Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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