Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERV3-1Q14264 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms