Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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FOXE3Q13461 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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