Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LMAN2Q12907 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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