Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTN1Q12860 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms