Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TROQ12816 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TROQ12816 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TROQ12816 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TROQ12816 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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