Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGNL1Q0VF96 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms