Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TYRO3Q06418 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms