Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CALD1Q05682 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms