Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms