Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms