Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms