Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms