Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms