Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms