Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX1P78337 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms