Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCCD1P59942 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms