Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIRAP54198 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms