Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP3M2P53677 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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