Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEK3P51956 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEK3P51956 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEK3P51956 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEK3P51956 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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