Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC3P51654 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC3P51654 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC3P51654 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC3P51654 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC3P51654 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC3P51654 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC3P51654 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC3P51654 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms