Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC11A1P49279 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms