Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCLMP48507 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms