Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CDKN1BP46527 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms