Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBRP36941 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBRP36941 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBRP36941 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBRP36941 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms