Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms