Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD247P20963 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms