Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASTP20810 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASTP20810 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASTP20810 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms