Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms