Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSPAN8P19075 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms