Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GOT1P17174 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOT1P17174 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOT1P17174 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms