Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms