Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms