Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC28A2O43868 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms